study pk で dicom ファイルの収納されているパスを取得します。
まずは、接続情報を外部ファイルに記録。
database.conf
[client]
database = pacsdb
user = heno
password = moheno
select.sh
#!/bin/bash
function filePath() {
query="SELECT filepath FROM files WHERE instance_fk IN (SELECT pk FROM instance WHERE series_fk IN (SELECT pk FROM series WHERE study_fk = '83'))"
result=$(mysql --defaults-extra-file=./database.conf -e "${query}")
if [[ $? -eq 0 ]]; then
for value in ${result}
do
echo "${value}"
done
else
echo "fail to select from mysql." 1>&2
fi
}
filePath
結果は
filepath
2021/11/12/12/823BFA57/823BFA59/81C090F6
2021/11/12/12/823BFA57/823BFA59/81C179B5
2021/11/12/12/823BFA57/823BFA59/81C1EE15
2021/11/12/12/823BFA57/823BFA59/81CBEE40
2021/11/12/12/823BFA57/823BFA59/81CC62A0
2021/11/12/12/823BFA57/823BFA59/81CCD700
2021/11/12/12/823BFA57/823BFA59/81CD4B60
2021/11/12/12/823BFA57/823BFA59/81CDBFC0
2021/11/12/12/823BFA57/823BFA59/81CE3420
2021/11/12/12/823BFA57/823BFA59/81CEA880
2021/11/12/12/823BFA57/823BFA59/E326D19D
2021/11/12/12/823BFA57/823BFA59/E326D19E
2021/11/12/12/823BFA57/823BFA59/E32727F6
2021/11/12/12/823BFA57/823BFA59/E32727F7
2021/11/12/12/823BFA57/823BFA59/E3272F7A
2021/11/12/12/823BFA57/823BFA59/E3272F7B
2021/11/12/12/823BFA57/823BFA59/E32736FE
2021/11/12/12/823BFA57/823BFA59/E32736FF
2021/11/12/12/823BFA57/823BFA59/E3273E82
2021/11/12/12/823BFA57/823BFA97/823BFA98